最常見的幼豬多系統衰竭綜合癥癥狀是豬只漸進性消瘦或生長遲緩，這也是所必需的臨床依據，其它癥狀有呼吸困難、腹股溝淋巴結腫大、腹瀉、貧血和黃疸。

在一只豬身上可能見不到上述所有的基本臨床癥狀，但在發病豬群可以見到所有的癥狀。比較少見的臨床癥狀有咳嗽、發熱、胃潰瘍、中樞神經系統障礙和突然死亡。一些臨床癥狀可能與繼發感染有關，或者完全是由幼豬多系統衰竭綜合癥繼發感染所引起的。

 　　防控辦法：首先要改變和完善飼養方式。做到養豬生產各階段的全進全出，避免將不同日齡的豬混群飼養，從而減少和降低豬群之間pcv2的接觸感染機會。建立豬場完善的生物安全體系，將消毒衛生工作貫穿于養豬生產的各個環節。最大限度地降低豬場內污染的病原微生物，減少或杜絕豬群繼發感染的機率。

很多應激因素都可誘發、促進幼豬多系統衰竭綜合癥的發生和加重發病豬群的病情，導致死亡率上升，因此應盡可能地減少豬群的應激因素，避免飼喂發霉變質或含有真菌毒素的飼料，作好豬舍的通風、換氣，改善豬舍的空氣質量，降低氨氣濃度。保持豬舍干燥，降低豬群的飼養密度。

    提高豬群的營養水平。幼豬多系統衰竭綜合癥感染可以導致豬群的免疫功能下降，因此營養是影響發病的一個重要因素。通過提高豬群的蛋白質、氨基酸、維生素和微量元素等水平，提高飼料的質量，提高斷奶豬的采食量，給仔豬飼喂濕料或粥料，保證仔豬充足的飲水，可以在一定程度上降低幼豬多系統衰竭綜合癥的發生率和造成的損失。